Los paises, o naciones, son gobernados por un señor feudal, y si éste país es lo suficientemente grande, tendrá su propia villa ninja. Por lo tanto, cada país que posea una villa ninja, tendrá mucho más poder, tanto económico, político, militar y social.

De cualquier manera, no es necesario que haya una villa ninja para conformar un país, simplemente, estas son un complemento de la nación en sí que la hace más poderosa en todos los aspectos.